TPS-INFO
Le poisson zèbre (Danio rerio) est devenu un modèle vertébré de choix pour l’étude de la fonction des gènes.
On estime que 82 % des gènes impliqués dans des maladies humaines possèdent un orthologue chez le poisson zèbre ce qui en fait un modèle pertinent pour étudier les conséquences moléculaires et cellulaires d’une modification génétique.
TPS-INFO a développé un pipeline de traitement et de gestion des données qui permet d’accéder facilement aux résultats d’imagerie 3D.
- L’équipe TPS-INFO développe des outils permettant la visualisation, l’analyse, le traitement et l’archivage des données images 2D et 3D.
Plusieurs axes de développement sont entrepris au sein de la plateforme, qui les priorise selon les besoins exprimés par la communauté scientifique :
- Raffiner les méthodologies d’édition du génome chez le poisson zèbre, les développer sur les autres espèces présentes dans TPS ;
- Simplifier et automatiser au maximum les protocoles de phénotypage par imagerie pour augmenter le débit ;
- Accélérer le traitement des données et améliorer leur gestion.
TPS-TCF propose chaque année une formation CNRS Formation Entreprises.
« Clarification pour l’imagerie tridimensionnelle » : formation sur la mise en oeuvre des différentes techniques de clarification.
« Clarification pour l’imagerie tridimensionnelle » : formation sur la mise en oeuvre des différentes techniques de clarification.
TPS-TCF à co-organisé en 2021-2022 un atelier Inserm (264) sur la transparisation.